En las áreas que rodean a los glaciares de la XI Región existen pocas especies de flora. Algunas de las más comunes son: la Nalca chica y la Nata Verde.
Tras las primeras estribaciones de la cordillera existen el Radal, la Lenga, el Aromo y el Colihue, así como el Pasto Miel, el Diente de León y el Llantén. Entre las especies herbáceas resaltan el Duraznillo, el Ñirre y la Paramela.
En el Parque Nacional Queulat se puede observar especies como el Coigüe, la Tepa, el Tepú, diversos arbustos de hermosas flores y enormes nalcas.
Al interior de la Reserva Nacional Lago Cochrane predomina el bosque caducifolio de Aysén, cuya especie representativa es la Lenga. También se encuentra el Ñirre, Coigüe común, Ciruelillo o Notro y especies arbustivas como Calafate, Michay, Chilco, Mata Verde y Chaura. La reserva se encuentra entre el bosque caducifolio y la estepa patagónica.
La vegetación nativa de la Reserva Nacional Coyhaique se encuentra representada por el Bosque mixto de Coigüe común y Lenga siendo la formación vegetacional predominante la del Bosque Caducifolio de Aysén. En sectores húmedos se presenta el Ñire. Existe una diversidad de especies exóticas destacan por la superficie que ocupan, el Pino Ponderosa, Pino Contorta, Pino Silvestre, Pino Oregón, entre otras. Respecto a los arbustos se pueden apreciar el Chilco, Zarzaparrilla, Calafate y Quila, entre otros.
La vegetación de la Reserva Nacional Lago Jeinemeni varía desde el oriente, donde es más esteparia, hacia el sector occidental, más húmedo, reconociéndose dos formaciones vegetacionales, Estepa Patagónica de Aysén, en que las especies representativas son: Vautro, Coiron, Coirón, Cadillo, Neneo y LLareta; el Bosque Caducifolio de Aysén en la que predomina la Lenga, en las partes bajas y valles el Ñirre, Calafate y Chaura y en los sectores más húmedos Coigüe común, Notro y Pasto miel.
El bosque dominante en la Reserva Nacional Río Simpson corresponde al de la formación vegetacional Siempre verde Montano, en la cual la especies representativas son el Coigüe común, y la Tepa, además son comunes el Canelo, el Notro o Ciruelillo y el Chilco. También se encuentran presentes las formaciones vegetacionales Bosque Caducifolio de Aysén y Matorrales Caducifolios Altimontanos, esta última se caracteriza por constituir el límite vegetacional arbóreo y por la forma achaparrada de las especies que lo componen, principalmente Ñire, Lenga y Calafate. Dentro de las especies arbustivas más abundante y típica de la zona se encuentra el Chilco.
La flora del Monumento Natural Dos Lagunas corresponde a aquella de un sector de transición entre el bosque caducifolio de Aysén y la estepa patagónica, sin embargo la formación vegetacional predominante corresponde al bosque caducifolio de Aysén, en la que las especies características son Ñirre, Calafate, Frutilla y Pasto Miel.

FUENTE: SERNATUR, CONAF